重音大多在最後一個音節，而且會區別意義

達悟語的重音大部分落在最後一個音節，所以通常不標示。

但重音具有辨義功能 —— 念錯位置會變成另一個詞。因此書上遇到重音不在最後的詞，會在音標層次標上重音符號（í、á、é、ó）。

規律性的例外：ma- 開頭的靜態動詞，重音多半落在倒數第二音節：
・masáray「很高興」、masasáray

另外，加了後綴之後重音會跟著移到後綴上：
・pasakay [pa.sa.kaj]「助使上去」→ 加 -en → [pa.sa.ka.jin]「放上去」

（以輔音結尾的詞加元音開頭的後綴時，那個輔音會變成後面音節的聲母：kadkad [kad.kad]「抓癢」→ [kad.ka.dəj]。）